由于艾曲波帕可以使血小板计数增加,因此这可能是导致血栓和血栓栓塞并发症的原因，并且在静脉和动脉都可能发生。当有血栓栓塞危险（例如，凝血因子V Leiden、抗凝血酶（AT-III）缺乏、抗磷脂综合征、慢性肝病）的患者使用艾曲波帕时，血栓栓塞风险会明显增大。
在慢性丙型肝炎和血小板减少症患者的两项临床试验中，使用艾曲波帕治疗的患者中3%的患者有血栓形成，安慰剂组有1%的患者有血栓形成，而大多数血栓形成在门静脉系统。
在一项对患有慢性肝病和与免疫性血小板减少症无关的血小板减少症患者使用艾曲波帕治疗的临床试验中，患者使用安曲波帕75mg每天一次，在完成艾曲波帕治疗后30天内有7人出现血栓并发症，血小板计数高于200x109/L，并且所有血栓并发症均为门静脉血栓形成；门静脉血栓的症状包括腹痛、恶心、呕吐和腹泻。
如果服用过量，血小板计数可能会过度增加并导致血栓形成/血栓栓塞并发症。
另外在一份报告中，一位患者服用了5000mg的艾曲波帕， 13天后血小板计数最大增加至到929x109/L，还出现皮疹、心动过缓、ALT/AST升高和疲劳；患者接受了洗胃、口服乳果糖、静脉输液、奥美拉唑、阿托品、呋塞米、钙、地塞米松和血浆置换等治疗，然而血小板计数高和肝功能检查异常持续了3周以上， 2个月后随访，身体已无大碍，无后遗症。
在艾曲波帕服用过量的情况下，可以口服含金属阳离子的制剂（例如钙、铝或镁制剂），能与艾曲波帕发生化学反应，形成稳定的环状结构，从而限制身体吸收，并密切监测血小板计数。
艾曲波帕会导致患者血栓形成的风险增加，特别是门静脉血栓形成的风险增加，因此为了尽量减少血栓形成和血栓栓塞并发症的风险；一定不要使用艾曲波帕强行使血小板计数达到正常人水平，或者过量使用，根据自身情况遵循医嘱谨慎调整剂量以达到和维持目标血小板计数。